Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VWC2Q2TAL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms