Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFIL3Q16649 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFIL3Q16649 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms