Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMN1Q16637 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMN1Q16637 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms