Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNAPC1Q16533 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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