Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDSNQ15517 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDSNQ15517 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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