Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERC3Q15034 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERC3Q15034 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms