Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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RBM39Q14498 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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RBM39Q14498 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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