Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBM39Q14498 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBM39Q14498 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBM39Q14498 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms