Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
BECN1Q14457 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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BECN1Q14457 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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