Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKBKEQ14164 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IKBKEQ14164 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKBKEQ14164 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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