Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCINQ13939 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCINQ13939 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCINQ13939 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCINQ13939 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCINQ13939 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCINQ13939 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCINQ13939 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCINQ13939 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCINQ13939 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCINQ13939 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCINQ13939 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCINQ13939 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCINQ13939 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCINQ13939 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms