Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC2Q13868 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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