Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA9Q13797 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA9Q13797 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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