Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME3Q13232 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME3Q13232 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME3Q13232 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME3Q13232 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME3Q13232 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME3Q13232 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME3Q13232 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME3Q13232 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME3Q13232 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME3Q13232 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME3Q13232 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME3Q13232 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME3Q13232 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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