Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPS1Q13098 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPS1Q13098 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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