Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FOXI1Q12951 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FOXI1Q12951 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXI1Q12951 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXI1Q12951 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXI1Q12951 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXI1Q12951 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FOXI1Q12951 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXI1Q12951 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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