Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 PER1YCR044C 1074 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 snR7-SsnR7-S 179 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 RNA15YGL044C 891 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 CIR1YGR207C 786 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 IMP3YHR148W 552 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 COA3YJL062W-A 258 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 ELO3YLR372W 1038 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 CTL1YMR180C 963 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 AIF1YNR074C 1137 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 VPS68YOL129W 555 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 TDA11YHR159W 1515 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 PEP5YMR231W 3090 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 MIH1YMR036C 1665 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 SSA2YLL024C 1920 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 SWC3YAL011W 1878 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 CLB5YPR120C 1308 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 MDR1YGR100W 2853 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 LSO1YJR005C-A 282 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 CPR3YML078W 549 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 SAP30YMR263W 606 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 TGS1YPL157W 948 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 MRPL37YBR268W 318 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 OLE1YGL055W 1533 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 GAS4YOL132W 1416 nt4.54□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 ENT1YDL161W 1365 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 ALG2YGL065C 1512 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 YDR336WYDR336W 945 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 CYM1YDR430C 2970 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 JLP1YLL057C 1239 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 SSP2YOR242C 1116 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 CLN2YPL256C 1638 nt4.53□□□□□ -1.68
SPE4Q12455 GAL4YPL248C 2646 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 RKM3YBR030W 1659 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 NUP116YMR047C 3342 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 NOP8YOL144W 1455 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YDR290WYDR290W 330 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 TYW3YGL050W 822 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 VPS29YHR012W 849 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YJR056CYJR056C 711 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YMR084WYMR084W 789 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ERD2YBL040C 660 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YMR178WYMR178W 825 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ALG11YNL048W 1647 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ALG6YOR002W 1635 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 IMD2YHR216W 1572 nt4.52□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 snR78snR78 87 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 MSS2YDL107W 1056 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ARF2YDL137W 546 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YDR161WYDR161W 1164 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 RRP45YDR280W 918 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 TFB3YDR460W 966 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 MRPS35YGR165W 1038 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YKL177WYKL177W 339 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 MRPL39YML009C 213 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 AAH1YNL141W 1044 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 HSP26YBR072W 645 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 POP4YBR257W 840 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 NNK1YKL171W 2787 nt4.51□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SPO1YNL012W 1896 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 NMD3YHR170W 1557 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 YDL027CYDL027C 1263 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 RPL34AYER056C-A 366 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SDT1YGL224C 843 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 VMA22YHR060W 546 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 DID4YKL002W 699 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 LAC1YKL008C 1257 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 PSY3YLR376C 729 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 MED7YOL135C 669 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SSO1YPL232W 873 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 UMP1YBR173C 447 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 BOI2YER114C 3123 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 PUF2YPR042C 3228 nt4.5□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SLM5YCR024C 1479 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 PEX19YDL065C 1029 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ARC1YGL105W 1131 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 DAM1YGR113W 1032 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ATG8YBL078C 354 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 FEX1YOR390W 1128 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 FEX2YPL279C 1128 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SHE3YBR130C 1278 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 CDC48YDL126C 2508 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 RTK1YDL025C 1863 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SMF1YOL122C 1728 nt4.49□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 PXA1YPL147W 2613 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 ECT1YGR007W 972 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 CAX4YGR036C 720 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 NMA1YLR328W 1206 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 PCL1YNL289W 840 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 FRE1YLR214W 2061 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 VHC1YBR235W 3363 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 GAD1YMR250W 1758 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 SAC1YKL212W 1872 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 IOC4YMR044W 1428 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 MAG2YLR427W 2013 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 AIM6YDL237W 1173 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE4Q12455 COQ4YDR204W 1008 nt4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms