Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	AHP1	YLR109W	531 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	RKM2	YDR198C	1440 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	VHS3	YOR054C	2025 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	PTM1	YKL039W	1572 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	PMC1	YGL006W	3522 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	APE2	YKL157W	2859 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	THI20	YOL055C	1656 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	MDJ2	YNL328C	441 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	YPL114W	YPL114W	420 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	DER1	YBR201W	636 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	MAP1	YLR244C	1164 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	VMS1	YDR049W	1899 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	YPL260W	YPL260W	1656 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	FAA1	YOR317W	2103 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SMC4	Q12267	POL3	YDL102W	3294 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	HSP42	YDR171W	1128 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	ALR2	YFL050C	2577 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	VTA1	YLR181C	993 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	FDH2	YPL275W	711 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	HRK1	YOR267C	2280 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	DTD1	YDL219W	453 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	MSB2	YGR014W	3921 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	LEU1	YGL009C	2340 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	SFI1	YLL003W	2841 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	EKI1	YDR147W	1605 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	YJR085C	YJR085C	318 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	RPA43	YOR340C	981 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	YHL049C	YHL049C	816 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	IRC25	YLR021W	540 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	MRPL51	YPR100W	423 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	MDL1	YLR188W	2088 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	VHC1	YBR235W	3363 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	DIN7	YDR263C	1293 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	YGL108C	YGL108C	423 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	RHO3	YIL118W	696 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	TDA8	YAL064C-A	381 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	OCA2	YNL056W	594 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	UTP23	YOR004W	765 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	YDR444W	YDR444W	2064 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SMC4	Q12267	YLR012C	YLR012C	300 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YNR063W	YNR063W	1824 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	VID28	YIL017C	2766 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	BMH1	YER177W	804 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	ERJ5	YFR041C	888 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	MYO5	YMR109W	3660 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YPL113C	YPL113C	1191 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	HOT1	YMR172W	2160 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	MSR1	YHR091C	1932 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	BOI2	YER114C	3123 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YCL075W	YCL075W	441 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YDR250C	YDR250C	276 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YHR180W	YHR180W	492 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	IML2	YJL082W	2196 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	ECM32	YER176W	3366 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YTM1	YOR272W	1383 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	PEX7	YDR142C	1128 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	RPS9B	YBR189W	588 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	ACK1	YDL203C	1872 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	GRC3	YLL035W	1899 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	MBB1	YJL199C	327 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	RIM11	YMR139W	1113 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	PKH1	YDR490C	2301 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	FUN30	YAL019W	3396 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	MCK1	YNL307C	1128 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	TGS1	YPL157W	948 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YPL216W	YPL216W	3309 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	PRP43	YGL120C	2304 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	DIP2	YLR129W	2832 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	CHD1	YER164W	4407 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	MDM1	YML104C	3384 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YBR137W	YBR137W	540 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	YLH47	YPR125W	1365 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	IME4	YGL192W	1803 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	AVT1	YJR001W	1809 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SMC4	Q12267	OAF1	YAL051W	3144 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	YPL077C	YPL077C	723 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	EXO5	YBR163W	1758 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	COX23	YHR116W	456 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	NOC2	YOR206W	2133 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	NUG1	YER006W	1563 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	STR2	YJR130C	1920 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	SHO1	YER118C	1104 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	YGR107W	YGR107W	450 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	DAM1	YGR113W	1032 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	MPA43	YNL249C	1629 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	PAM1	YDR251W	2493 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	ECM16	YMR128W	3804 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	BUD27	YFL023W	2391 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	TRM1	YDR120C	1713 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	NSA2	YER126C	786 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	MAD2	YJL030W	591 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	CDC26	YFR036W	375 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SMC4	Q12267	MED4	YOR174W	855 nt		5.23	□□□□□ -1.57

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