Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YMR1YJR110W 2067 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 MPA43YNL249C 1629 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 KNH1YDL049C 807 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 PHO13YDL236W 939 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RSM10YDR041W 612 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 HPT1YDR399W 666 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 UBC6YER100W 753 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 COS4YFL062W 1140 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YGR073CYGR073C 372 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 REC107YJR021C 945 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 FUN19YAL034C 1242 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YLR287CYLR287C 1068 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 MRPL44YMR225C 297 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 CWC27YPL064C 906 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 SEC62YPL094C 825 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 OPI11YPR044C 354 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YGL176CYGL176C 1665 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RNY1YPL123C 1305 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YIG1YPL201C 1386 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 DAL7YIR031C 1665 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 MMT2YPL224C 1455 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 AAD3YCR107W 1092 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YDR269CYDR269C 324 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YGR160WYGR160W 612 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 ECM14YHR132C 1293 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 SVP26YHR181W 687 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 UBI4YLL039C 1146 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YMR087WYMR087W 855 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 CUZ1YNL155W 825 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YNR014WYNR014W 639 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RIB4YOL143C 510 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 PSF3YOL146W 585 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 CAR1YPL111W 1002 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 NIP7YPL211W 546 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 SUA7YPR086W 1038 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 DCC1YCL016C 1143 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 AEP2YMR282C 1743 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RAD18YCR066W 1464 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 IBA57YJR122W 1494 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RXT3YDL076C 885 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RRP42YDL111C 798 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 NKP1YDR383C 717 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 THI5YFL058W 1023 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 TIM21YGR033C 720 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 CAP1YKL007W 807 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YNR021WYNR021W 1215 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YPL197CYPL197C 414 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 PLB2YMR006C 2121 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 NAF1YNL124W 1479 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 PES4YFR023W 1836 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 UGA3YDL170W 1587 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 GIR2YDR152W 798 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YIL077CYIL077C 963 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YKL136WYKL136W 399 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YLR374CYLR374C 390 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YOR248WYOR248W 303 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YOR268CYOR268C 399 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YPL113CYPL113C 1191 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 MAK3YPR051W 531 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 CUE2YKL090W 1332 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 AIM17YHL021C 1398 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 COQ1YBR003W 1422 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 ECM38YLR299W 1983 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 SLA2YNL243W 2907 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 PUP2YGR253C 783 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YHR095WYHR095W 495 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 EAF6YJR082C 342 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YLR125WYLR125W 411 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 GIM5YML094W 492 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RRN9YMR270C 1098 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 NIS1YNL078W 1224 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 EMP47YFL048C 1338 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 NOP7YGR103W 1818 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 RSP5YER125W 2430 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 AGP2YBR132C 1791 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 YDL057WYDL057W 987 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 GCN4YEL009C 846 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 TRR2YHR106W 1029 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 MPC2YHR162W 390 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 OPI8YKR035C 642 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 TSR4YOL022C 1227 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 TUB1YML085C 1344 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 ARP3YJR065C 1350 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 SLY41YOR307C 1362 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 RVB2YPL235W 1416 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 GAS5YOL030W 1455 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 BRN1YBL097W 2265 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 NOP58YOR310C 1536 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 BDF2YDL070W 1917 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 SKY1YMR216C 2229 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 VPS72YDR485C 2388 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-BLQ12266 RSM18YER050C 417 nt6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms