Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 CLB2YPR119W 1476 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 UTP7YER082C 1665 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 BEM1YBR200W 1656 nt7.66□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YCR064CYCR064C 411 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 NUP42YDR192C 1293 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 AFG1YEL052W 1530 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 CGR1YGL029W 363 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 EGD2YHR193C 525 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YKL147CYKL147C 618 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 AHP1YLR109W 531 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 TUB1YML085C 1344 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 ATO2YNR002C 849 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YOL159CYOL159C 516 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 CKA2YOR061W 1020 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 PRO2YOR323C 1371 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 FRE5YOR384W 2085 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 ASR1YPR093C 867 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 FUS1YCL027W 1539 nt7.65□□□□□ -1.18
NCR1Q12200 APE4YHR113W 1473 nt7.64□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 ERR3YMR323W 1314 nt7.64□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.64□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.64□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 BRN1YBL097W 2265 nt7.64□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 THP1YOL072W 1368 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YGR151CYGR151C 336 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 EAF6YJR082C 342 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 LCL2YLR104W 396 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 TOM22YNL131W 459 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 NIP7YPL211W 546 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MCM16YPR046W 546 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MAK3YPR051W 531 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 AEP2YMR282C 1743 nt7.63□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 CDC7YDL017W 1524 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 BOP2YLR267W 1713 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YDR199WYDR199W 366 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YDR248CYDR248C 582 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 CHZ1YER030W 462 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 BUD13YGL174W 801 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YHI9YHR029C 885 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YMR141CYMR141C 309 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 RRT16YNL105W 429 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 HTZ1YOL012C 405 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YOL029CYOL029C 606 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YOR082CYOR082C 342 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 IAH1YOR126C 717 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 FIT2YOR382W 462 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 RTC2YBR147W 891 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 PRI2YKL045W 1587 nt7.62□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MRPS35YGR165W 1038 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 ATG27YJL178C 816 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MRT4YKL009W 711 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MDH1YKL085W 1005 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 LST8YNL006W 912 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 HCH1YNL281W 462 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 CDC28YBR160W 897 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 FCY22YER060W-A 1593 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 CDC13YDL220C 2775 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YLL058WYLL058W 1728 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 COQ6YGR255C 1440 nt7.61□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MSS51YLR203C 1311 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MSN1YOL116W 1149 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YGK3YOL128C 1128 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MRPL37YBR268W 318 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 SSC1YJR045C 1965 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 COX15YER141W 1461 nt7.6□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 PGS1YCL004W 1566 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 ZRC1YMR243C 1329 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 RGI1YER067W 486 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 COS4YFL062W 1140 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YNR005CYNR005C 405 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 MAM3YOL060C 2121 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YOR314WYOR314W 330 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 DCC1YCL016C 1143 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 PTR2YKR093W 1806 nt7.59□□□□□ -1.19
NCR1Q12200 YRB30YGL164C 1323 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 MPC2YHR162W 390 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 CGI121YML036W 546 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 BUB3YOR026W 1026 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 YBR226CYBR226C 411 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 RPN4YDL020C 1596 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 HXT7YDR342C 1713 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 HXT6YDR343C 1713 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 PUB1YNL016W 1362 nt7.58□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 COT1YOR316C 1320 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 PRR2YDL214C 2100 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 MUP3YHL036W 1641 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 BUD30YDL151C 582 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 MRPL7YDR237W 879 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 YDR327WYDR327W 327 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 PRS2YER099C 957 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 AGX1YFL030W 1158 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 VPS24YKL041W 675 nt7.57□□□□□ -1.2
NCR1Q12200 YBR209WYBR209W 318 nt7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.4 ms