Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 EMP70YLR083C 2004 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 TOS3YGL179C 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 CKA2YOR061W 1020 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 PWR1PWR1 941 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 VPS73YGL104C 1461 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 UBX5YDR330W 1503 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 APE1YKL103C 1545 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 TDA7YNL176C 1911 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 PHO86YJL117W 936 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 CDC8YJR057W 651 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 PFA4YOL003C 1137 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 CWC27YPL064C 906 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 TRM1YDR120C 1713 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 IML2YJL082W 2196 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 UPS3YDR185C 540 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 RIM9YMR063W 720 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 ATG8YBL078C 354 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 VMS1YDR049W 1899 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 MSR1YHR091C 1932 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 YDR444WYDR444W 2064 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 APC9YLR102C 798 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 DER1YBR201W 636 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 IRS4YKR019C 1848 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 PRP19YLL036C 1512 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-BRQ12193 COX23YHR116W 456 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 MRH1YDR033W 963 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 BMH1YER177W 804 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 ZRC1YMR243C 1329 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 XKS1YGR194C 1803 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 NPY1YGL067W 1155 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 VTA1YLR181C 993 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 APE2YKL157W 2859 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 HOM3YER052C 1584 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 CPR6YLR216C 1116 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 COA4YLR218C 453 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 HAL5YJL165C 2568 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 PAM1YDR251W 2493 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 SRB6YBR253W 366 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 OMS1YDR316W 1416 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 PAN1YIR006C 4443 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 YGR051CYGR051C 324 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 MDY2YOL111C 639 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 BOI2YER114C 3123 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 BNA5YLR231C 1362 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 PEX7YDR142C 1128 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 IRC9YJL142C 393 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 YJR128WYJR128W 360 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 RIM11YMR139W 1113 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 THI7YLR237W 1797 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 SEG2YKL105C 3399 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-BRQ12193 SUE1YPR151C 621 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 NOP7YGR103W 1818 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 NGL2YMR285C 1548 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 COS8YHL048W 1146 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YBL059WYBL059W 582 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YOR387CYOR387C 621 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YPL114WYPL114W 420 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YML020WYML020W 1995 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 MNN11YJL183W 1269 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YAR061WYAR061W 204 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 SHE1YBL031W 1017 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 MRPL16YBL038W 699 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 NAT3YPR131C 588 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YBR137WYBR137W 540 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 MET10YFR030W 3108 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 EXO5YBR163W 1758 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 UTP9YHR196W 1728 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 EXO1YOR033C 2109 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 MCX1YBR227C 1563 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 PRE9YGR135W 777 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 CHD1YER164W 4407 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YJL175WYJL175W 513 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 MAK16YAL025C 921 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 FSH3YOR280C 801 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 ARG5,6YER069W 2592 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 VBA1YMR088C 1689 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 DRS2YAL026C 4068 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 SPT15YER148W 723 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YGR053CYGR053C 852 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 TEM1YML064C 738 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 MCK1YNL307C 1128 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 NIP7YPL211W 546 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 AVT1YJR001W 1809 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 YKL050CYKL050C 2769 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 COX14YML129C 213 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 EKI1YDR147W 1605 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-BRQ12193 IME4YGL192W 1803 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 APC11YDL008W 498 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 PRE4YFR050C 801 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 RPL8AYHL033C 771 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 RIM15YFL033C 5313 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 AIM17YHL021C 1398 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 HSP82YPL240C 2130 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 YIL054WYIL054W 318 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 YFL052WYFL052W 1398 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-BRQ12193 BUB1YGR188C 3066 nt5.19□□□□□ -1.58
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