Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	UBC1	YDR177W	648 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	HIS6	YIL020C	786 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	SRP40	YKR092C	1221 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YPL073C	YPL073C	486 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	MLH2	YLR035C	2088 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	BRE4	YDL231C	3378 nt		4.05	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	IDS2	YJL146W	1410 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	POL12	YBL035C	2118 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	SRP72	YPL210C	1923 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YGL132W	YGL132W	336 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	RPL14A	YKL006W	417 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	DBR1	YKL149C	1218 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	NSE1	YLR007W	1011 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	SRN2	YLR119W	642 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	SUI1	YNL244C	327 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	ARR1	YPR199C	885 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YBR219C	YBR219C	384 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	KTR7	YIL085C	1554 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	ATG32	YIL146C	1590 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	RNA14	YMR061W	2034 nt		4.04	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	HSP31	YDR533C	714 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	LNP1	YHR192W	837 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YLR156W	YLR156W	345 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YLR159W	YLR159W	345 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	YLR161W	YLR161W	345 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	IDP2	YLR174W	1239 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	GDT1	YBR187W	843 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	TAF8	YML114C	1533 nt		4.03	□□□□□ -1.76
VIK1	Q12045	ABP140	YOR239W	1887 nt		4.03	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	PCL10	YGL134W	1302 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	MNN4	YKL201C	3537 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RPS13	YDR064W	456 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	ECM34	YHL043W	513 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YLR124W	YLR124W	345 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	TIF5	YPR041W	1218 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	UBA3	YPR066W	900 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	FRM2	YCL026C-A	582 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	FYV5	YCL058C	459 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SPO77	YLR341W	1434 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	FMP25	YLR077W	1752 nt		4.02	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	IOC2	YLR095C	2439 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	PTR3	YFR029W	2037 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RPB2	YOR151C	3675 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	PTA1	YAL043C	2358 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	COX2	Q0250	756 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	IES3	YLR052W	753 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	UIP3	YAR027W	708 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SSO1	YPL232W	873 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.01	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	EKI1	YDR147W	1605 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YDL109C	YDL109C	1944 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	CIA2	YHR122W	696 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SOP4	YJL192C	705 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	NKP2	YLR315W	462 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	REX4	YOL080C	870 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	CEG1	YGL130W	1380 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	MST1	YKL194C	1389 nt		4	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SUL2	YLR092W	2682 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	ATM1	YMR301C	2073 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	GAS5	YOL030W	1455 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	DXO1	YDR370C	1329 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	CHD1	YER164W	4407 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YGL262W	YGL262W	528 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YIL163C	YIL163C	354 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SEC72	YLR292C	582 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	NCE103	YNL036W	666 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	ELA1	YNL230C	1140 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	snR37	snR37	386 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	NCR1	YPL006W	3513 nt		3.99	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RKM4	YDR257C	1485 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RAD26	YJR035W	3258 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	PHO13	YDL236W	939 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	NBP2	YDR162C	711 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RTA1	YGR213C	954 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	MRP4	YHL004W	1185 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YLR036C	YLR036C	612 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	RPS0B	YLR048W	759 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	PCL1	YNL289W	840 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	EFM2	YBR271W	1260 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.98	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SET4	YJL105W	1683 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	SPO73	YER046W	432 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YFR045W	YFR045W	930 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	YMR114C	YMR114C	1107 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	PNG1	YPL096W	1092 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	VPS45	YGL095C	1734 nt		3.97	□□□□□ -1.77
VIK1	Q12045	VPS36	YLR417W	1701 nt		3.97	□□□□□ -1.77

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