Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSRP1Q08945 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms