Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSC1Q08554 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSC1Q08554 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DSC1Q08554 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC1Q08554 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC1Q08554 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms