Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DHX9Q08211 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX9Q08211 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms