Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 CAB2YIL083C 1098 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 VPS25YJR102C 609 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MRP17YKL003C 396 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SDS22YKL193C 1017 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YAL069WYAL069W 315 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SHE1YBL031W 1017 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RRT1YBL048W 312 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 GPI12YMR281W 915 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ICS2YBR157C 768 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 FLC3YGL139W 2409 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 BIT2YBR270C 1638 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 PPR1YLR014C 2715 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MGA1YGR249W 1371 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YGL036WYGL036W 2730 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RDI1YDL135C 609 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MHF2YDL160C-A 243 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 NRG1YDR043C 696 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YGR226CYGR226C 210 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 COX6YHR051W 447 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 CKA1YIL035C 1119 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 PRP21YJL203W 843 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MTW1YAL034W-A 870 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ATG38YLR211C 681 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YPT6YLR262C 648 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YNL320WYNL320W 855 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 BUD17YNR027W 954 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 CCL1YPR025C 1182 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RRP7YCL031C 894 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 NOP2YNL061W 1857 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 TYR1YBR166C 1359 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 APE1YKL103C 1545 nt5.28□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 PST1YDR055W 1335 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 TFC7YOR110W 1308 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 KTR6YPL053C 1341 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SLT2YHR030C 1455 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 DAK1YML070W 1755 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YDL034WYDL034W 345 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 FOB1YDR110W 1701 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 MBR1YKL093W 1020 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SEC13YLR208W 894 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 REC102YLR329W 795 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 ADE13YLR359W 1449 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 MRPL16YBL038W 699 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 ARG1YOL058W 1263 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 snR11snR11 258 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YHR177WYHR177W 1362 nt5.27□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SIP5YMR140W 1470 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 NGR1YBR212W 2019 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 ERT1YBR239C 1590 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 EIS1YMR031C 2532 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 TRM13YOL125W 1431 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 GIR2YDR152W 798 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 UBC1YDR177W 648 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 COBQ0105 1158 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 EFG1YGR271C-A 702 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 TEM1YML064C 738 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 LEM3YNL323W 1245 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 PIN2YOR104W 849 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YOR283WYOR283W 693 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 TYE7YOR344C 876 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 GEP3YOR205C 1671 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 CIK1YMR198W 1785 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 BDP1YNL039W 1785 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 FBP26YJL155C 1359 nt5.26□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YHR045WYHR045W 1683 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 HOS1YPR068C 1413 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 UBP7YIL156W 3216 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 CPR4YCR069W 957 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 COX26YDR119W-A 201 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SPT15YER148W 723 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YAR069CYAR069C 294 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 LST8YNL006W 912 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 TMA16YOR252W 537 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SPO1YNL012W 1896 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 CLA4YNL298W 2529 nt5.25□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 QDR1YIL120W 1692 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YNL011CYNL011C 1335 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YFL040WYFL040W 1623 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 COQ4YDR204W 1008 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 TYS1YGR185C 1185 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 PEX21YGR239C 867 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 PGU1YJR153W 1086 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 HMX1YLR205C 954 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 RUF22RUF22 515 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YBL096CYBL096C 309 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YNG1YOR064C 660 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 ARR3YPR201W 1215 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SPT14YPL175W 1359 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 PCL8YPL219W 1479 nt5.24□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 REF2YDR195W 1602 nt5.23□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 VPS1YKR001C 2115 nt5.23□□□□□ -1.57
CDA1Q06702 SYG1YIL047C 2709 nt5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.4 ms