Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSME1Q06323 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PSME1Q06323 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms