Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN1Q05586 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIN1Q05586 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms