Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRB3Q04118 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms