Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	OPY2	YPR075C	1083 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	CKS1	YBR135W	453 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YNR065C	YNR065C	3351 nt		4.96	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	STB2	YMR053C	2553 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	LSM6	YDR378C	261 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	RAI1	YGL246C	1164 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	GRE1	YPL223C	507 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YJL206C	YJL206C	2277 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	MPC54	YOR177C	1395 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YIL152W	YIL152W	708 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	PER33	YLR064W	822 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	CDC42	YLR229C	576 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	TGS1	YPL157W	948 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	GAL4	YPL248C	2646 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	SAS4	YDR181C	1446 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	SSL1	YLR005W	1386 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	RMD1	YDL001W	1293 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YDR282C	YDR282C	1245 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YGR015C	YGR015C	987 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	FUR1	YHR128W	651 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	SNL1	YIL016W	480 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	LTO1	YNL260C	597 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	VPS69	YPR087W	321 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	CYC1	YJR048W	330 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	ELO3	YLR372W	1038 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	KIN4	YOR233W	2403 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	DAS2	YDR020C	699 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YGR266W	YGR266W	2106 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	IGO2	YHR132W-A	396 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	STP4	YDL048C	1473 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	ISR1	YPR106W	1332 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	GLC3	YEL011W	2115 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	RAD52	YML032C	1416 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	snR57	snR57	88 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	PER1	YCR044C	1074 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	TAF4	YMR005W	1167 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	MCM1	YMR043W	861 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	HEK2	YBL032W	1146 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	TIF34	YMR146C	1044 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	EOS1	YNL080C	1101 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	SET6	YPL165C	1122 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	NNK1	YKL171W	2787 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	PHO87	YCR037C	2772 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	FKH2	YNL068C	2589 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SYF1	Q04048	HSP30	YCR021C	999 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	LSB1	YGR136W	726 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YBL081W	YBL081W	1107 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	MRP21	YBL090W	534 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YBR134W	YBR134W	402 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	AXL2	YIL140W	2472 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	COS7	YDL248W	1152 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	MRP4	YHL004W	1185 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	YIL086C	YIL086C	309 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	Q04048	COS5	YJR161C	1152 nt		4.89	□□□□□ -1.63

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