Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAP1Q03518 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAP1Q03518 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms