Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms