Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX6A2Q02221 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX6A2Q02221 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms