Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP2P81877 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP2P81877 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSBP2P81877 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms