Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFI35P80217 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFI35P80217 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFI35P80217 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFI35P80217 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFI35P80217 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFI35P80217 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFI35P80217 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFI35P80217 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms