Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELF3P78545 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELF3P78545 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELF3P78545 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELF3P78545 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELF3P78545 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELF3P78545 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELF3P78545 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELF3P78545 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELF3P78545 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELF3P78545 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELF3P78545 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELF3P78545 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELF3P78545 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELF3P78545 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms