Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IRX3P78415 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IRX3P78415 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX3P78415 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IRX3P78415 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IRX3P78415 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IRX3P78415 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX3P78415 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX3P78415 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX3P78415 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX3P78415 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IRX3P78415 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IRX3P78415 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IRX3P78415 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms