Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HBBP68871 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HBBP68871 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HBBP68871 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HBBP68871 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HBBP68871 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HBBP68871 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HBBP68871 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms