Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL38P63173 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL38P63173 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL38P63173 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL38P63173 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL38P63173 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL38P63173 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL38P63173 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL38P63173 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL38P63173 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL38P63173 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL38P63173 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL38P63173 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RPL38P63173 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL38P63173 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL38P63173 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL38P63173 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL38P63173 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms