Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL11P62913 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL11P62913 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL11P62913 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL11P62913 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL11P62913 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL11P62913 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL11P62913 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL11P62913 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL11P62913 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL11P62913 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL11P62913 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL11P62913 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL11P62913 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL11P62913 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL11P62913 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms