Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVS71-1P61550 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms