Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA9P57773 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA9P57773 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA9P57773 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJA9P57773 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJA9P57773 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJA9P57773 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJA9P57773 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJA9P57773 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA9P57773 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA9P57773 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA9P57773 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA9P57773 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA9P57773 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJA9P57773 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA9P57773 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA9P57773 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA9P57773 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJA9P57773 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA9P57773 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA9P57773 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA9P57773 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA9P57773 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA9P57773 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms