Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBASH3AP57075 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBASH3AP57075 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBASH3AP57075 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms