Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP1P56182 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP1P56182 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP1P56182 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP1P56182 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP1P56182 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP1P56182 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RRP1P56182 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP1P56182 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP1P56182 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRP1P56182 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRP1P56182 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RRP1P56182 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1P56182 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1P56182 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1P56182 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1P56182 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1P56182 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1P56182 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP1P56182 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP1P56182 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1P56182 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1P56182 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1P56182 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1P56182 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1P56182 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1P56182 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms