Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP7P55210 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP7P55210 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP7P55210 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP7P55210 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP7P55210 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP7P55210 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP7P55210 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP7P55210 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP7P55210 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP7P55210 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CASP7P55210 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP7P55210 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP7P55210 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP7P55210 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP7P55210 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP7P55210 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP7P55210 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP7P55210 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP7P55210 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASP7P55210 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP7P55210 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP7P55210 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP7P55210 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP7P55210 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP7P55210 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP7P55210 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP7P55210 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP7P55210 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP7P55210 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP7P55210 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP7P55210 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP7P55210 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP7P55210 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms