Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HADHBP55084 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HADHBP55084 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HADHBP55084 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HADHBP55084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHBP55084 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHBP55084 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHBP55084 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHBP55084 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HADHBP55084 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HADHBP55084 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HADHBP55084 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms