Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLTPP55058 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLTPP55058 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLTPP55058 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLTPP55058 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLTPP55058 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLTPP55058 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLTPP55058 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLTPP55058 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLTPP55058 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLTPP55058 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLTPP55058 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PLTPP55058 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLTPP55058 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLTPP55058 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLTPP55058 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLTPP55058 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLTPP55058 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLTPP55058 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLTPP55058 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLTPP55058 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLTPP55058 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms