Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP3P54108 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CRISP3P54108 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRISP3P54108 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms