Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRISP1P54107 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms