Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPAP53621 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPAP53621 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPAP53621 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPAP53621 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPAP53621 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPAP53621 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPAP53621 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPAP53621 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
COPAP53621 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPAP53621 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPAP53621 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPAP53621 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPAP53621 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPAP53621 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPAP53621 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPAP53621 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPAP53621 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPAP53621 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPAP53621 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPAP53621 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPAP53621 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPAP53621 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms