Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MVDP53602 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MVDP53602 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MVDP53602 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MVDP53602 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MVDP53602 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MVDP53602 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MVDP53602 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MVDP53602 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MVDP53602 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MVDP53602 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MVDP53602 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms